تؤمن الكنيسة القبطية الأرثوذكسية بسبعة أسرار، هي أساس وقوام الإيمان والتعليم الأرثوذكسي، وهي أعمال مقدسة ومنح إلهية، ينال بها الإنسان نعمة غير منظورة، تحت مادة منظورة.
وتعني كلمة "سر" في أسرار الكنيسة السبعة المقدسة، هو "نوال نعمة سرية (غير منظورة) بواسطة مادة منظورة" وذلك بفعل روح الله القدوس الذي حل بمواهبه في يوم الخمسين على التلاميذ القديسين ورسل السيد المسيح، وبحسب ما أسسه السيد المسيح نفسه وسلَّمه للرسل الأطهار وهم بدورهم سلَّموه للكهنة بوضع اليد الرسولية.
والأسرار الكنيسة السبعة هي..
1- سر المعمودية (يو5:3؛ أف25:5؛ 1كو11:6)
المعمودية هي مثال لموت المسيح ودفنه "أم تجهلون أننا كل من اعتمد ليسوع المسيح اعتمدنا لموته فدفنا معه بالمعمودية للموت حتى كما أقيم المسيح من الأموات بمجد الآب هكذا نسلك نحن أيضًا في جدة الحياة لأنه إن كنا قد صرنا متحدين معه بشبه موته نصير أيضًا بقيامته" (رسالة رومية 6:4) لذا المعمودية بالتغطيس والسيد المسيح نفسه تعمد بالتغطيس (إنجيل متى 3: 16) والخصي الحبشي أيضًا (أعمال الرسل 8: 36).
2- سر الميرون
والميرون كلمة تعني طيب مقدس أو دهن مقدس، يدهن به بعد المعمودية.
3- سر القربان أو تناول جسد الرب ودمه
التناول المقدس له قدسيته الخاصة ويجب التناول منه باستحقاق أي التوبة والنقاوة والإيمان بفاعلية السر.
4- سر التوبة والاعتراف
أسس الرب هذا السر قديمًا والاعتراف له شروطه بأن الإنسان يعترف في قرارة نفسه بالخطأ ويعترف أمام الله وأمام من أخطأ في حقه وأن يعترف أمام الأب الكاهن الذي أخذ سلطان الحل والربط.
5- سر مسحة المرضى
هذا السر من أسرار الكنيسة السبعة وهو للشفاء من أمراض النفس والجسد والروح بمغفرة الخطايا وأسسه الرب يسوع له المجد في العهد الجديد وهذا الزيت عبارة عن زيت نقي ثم يصلي عليه الكاهن ويوضع فيهم سبع فتائل من القطن ويصلي عليهم سبع صلوات مرتبه منذ عهد الرسل ومتفق عليها من جميع الكنائس الرسولية ويوقدون سبع فتائل رمز لكمال حلول مواهب الروح القدس لشفاء المريض باسم الرب يسوع وصلاة الإيمان تشفي المريض.
6- سر الزيجة أي الزواج
سر الزواج هو من أول الأسرار التي أسسها الرب الإله منذ بدء الخليقة وهو الذي قام بنفسه بإتمام هذا السر عندما رأى أنه "ليس جيدًا أن يكون آدم وحده فاصنع له معينا نظيره".
7- سر الكهنوت
سر الكهنوت هو تاج الأسرار لأنه بدونه لا يمكن للكنيسة أن تستمر ولا يمكن لأحد أن ينال مواهب الروح القدس بدونه وهذا السر قد تأسس منذ البدء كباقي الأسرار المقدسة.